TÜ Viljandi kultuuriakadeemiat juhib direktori kohusetäitja ja õppedirektor Kadri Steinbach. Direktor tagab muuhulgas kultuuriakadeemia tegevuse vastavuse arenguprioriteetidele, käesolevale põhikirjale, ülikooli põhikirjale, seadustele ning muudele õigusaktidele. Lisaks vastutab direktor eraldatud raha ja muu vara õiguspärase ja otstarbeka kasutamise eest, teostab administratiiv- ja distsiplinaarvõimu, kinnitab kultuuriakadeemia struktuuri ning vastutab õppetöö korralduse, õppetöö taseme ja eelarve täitmise eest.
Kultuuriakadeemia juhatusse kuulub lisaks direktorile kohusetäitjale haldusdirektor Reevo Maidla.